2001年起，中山大学高等继续教育开始成立专门的项目部（培训二部前身）在外地开办工商管理高级研修班。仅4年时间，我部在校外开办了10余个教学点，31个班级（包括东莞1－7期，中山1－7期，惠州1－3期，深圳1－4期，开平1－2期，江门1－2期，番禺1－4期，廉江班，茂名班），为珠三角地区企业培训学员近2000人；同时在2002年率先开办了总裁研修班。
　　2004年学院经过内部结构调整成立培训二部，除继续管理部分外地教学点外，逐渐将重心转移至广州的在职经理班和总裁班的教学，同时适应市场需求，率先开办了营销总监班。2004年至今，培训二部管理和开办的班级共48个，学员人数超过3800人。